Евгения Николаевича не стало 8 сентября. Он погиб вместе с режиссером Александром Мельником под Норильском во время проведения учений – оба одновременно упали с огромной высоты – министр пытался спасти оступившегося, но и сам не удержал равновесие на краю обрыва на Большом Иркиндинском водопаде.
Зиничев стал Героем РФ посмертно. Прощание с министром состоялось накануне в Москве, похоронили же его на Северном кладбище Санкт-Петербурга, где покоятся его родители.
В день похорон Евгения Николаевича спасатели всей страны выразили свою скорбь, включив пожарные сирены и проблесковые маячки на автомобилях.
